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1. 基線噪聲
a、氘燈問題。氘燈壽命到了時，基線不穩定有噪聲產生。氘燈發射出的光的強度不穩定，就像日光燈壽命終止時亮度在不斷變化。計算一下使用的時間或看一下計時器即可判斷。現象：基線呈或上或下的無規則變化。
b、檢測池內有氣泡。流動相流動時，引起微小氣泡的抖動，光強隨著變化（氣體與流動相對波長的吸收度不同）。排除方法：將池子液體出口處用吸耳球的任何部位堵住，此時，壓力顯示會增加一點，氣泡被壓縮很小很小，然后突然松開，氣泡會突然膨脹隨液體流出，反復多次即可排除。
c、檢測池內污染。有微小的顆粒隨流動相的流動在晃動，引起吸收值的變化。檢查方法：取下池子，用吸耳球吹凈池內的液體，在陽光下觀察池內情況，必要時拆開清洗。污染物的來源大致是樣品長期累積、柱填料流出等。
以上三種情況可以這樣進行判斷：泵停止運轉，分別觀察參比值R、測量值S的穩定性，方法是分別按下參比鍵、測量鍵不動，顯示值在變化（R值和S值），可以判斷氘燈是否有問題，壽命是否終止期到了。如果R值很穩定，S值不穩定（此時泵正常運轉）則判斷池體內有氣泡或污染。
2. 基線漂移
a、溶解在流動相中的氣體在池體內突然減壓，產生氣泡（微小）逐漸增大，逐漸使吸收度改變引起漂移。排除方法同上述1.b。
b、環境溫度變化較大，使儀器內的溫度隨之變化，電力工作點改變引起漂移。流動相、柱子隨溫度的變化也會引起漂移。應盡量減小溫度的變化。
c、柱子長期大量不斷的進樣品，有些比較重的組份會慢慢不斷的流出，形成漂移，這時候需要對柱子進行清洗。流動相中加入緩沖液時，用完后沖洗不*，再開機時也會出現基線漂移的現象。
以上現象的判斷必須保證積分儀、工作站等設備工作正常。
3. 檢測器不能正常調零。
a、檢測器本身電路故障，如氘燈不啟輝，調零鍵開關接觸不上均可出現調*（外接調零試一下是否正常調零）。
b、池體污染嚴重，如石英片內外污物遮擋，使透過率大大降低，S值很小，調零電路無法進行工作。
c、流動相本身的質量問題，緩沖液配錯成份均能引起S值的改變。
d、氘燈壽命，能量降低、S值下降等引起不調零。但是絕大多數情況是基線不穩定。
4. 儀器靈敏度突然下降。
a、檢測波長旋扭是否指在所需要的波長上（有可能無意之中改變了波長的位置）。
b、流量是否正確。
c、積分儀、工作站工作情況是否正常（這種情況一般不易發生）。
